MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 81742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011726	GTT	2	6	75	80	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244893
2	NC_011726	AGA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244893
3	NC_011726	GGT	2	6	99	104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244893
4	NC_011726	TTA	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244893
5	NC_011726	TTAT	2	8	197	204	25 %	75 %	0 %	0 %	218244893
6	NC_011726	GAC	2	6	216	221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244893
7	NC_011726	A	7	7	235	241	100 %	0 %	0 %	0 %	218244893
8	NC_011726	AGA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244894
9	NC_011726	GAT	2	6	573	578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244894
10	NC_011726	ATT	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244894
11	NC_011726	CCT	2	6	624	629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244894
12	NC_011726	CTT	2	6	694	699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244894
13	NC_011726	AGA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244894
14	NC_011726	TTG	2	6	949	954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244894
15	NC_011726	AAC	2	6	964	969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244894
16	NC_011726	TAG	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244894
17	NC_011726	AAT	3	9	1105	1113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244894
18	NC_011726	C	6	6	1264	1269	0 %	0 %	0 %	100 %	218244895
19	NC_011726	TAT	2	6	1436	1441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244895
20	NC_011726	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	218244895
21	NC_011726	GGTC	2	8	1625	1632	0 %	25 %	50 %	25 %	218244895
22	NC_011726	TGC	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244895
23	NC_011726	G	7	7	1713	1719	0 %	0 %	100 %	0 %	218244895
24	NC_011726	T	6	6	1792	1797	0 %	100 %	0 %	0 %	218244895
25	NC_011726	TCG	2	6	1877	1882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244895
26	NC_011726	T	6	6	1889	1894	0 %	100 %	0 %	0 %	218244895
27	NC_011726	GAT	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244895
28	NC_011726	AAG	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244895
29	NC_011726	ATT	2	6	1946	1951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244895
30	NC_011726	CCTAC	2	10	2025	2034	20 %	20 %	0 %	60 %	218244895
31	NC_011726	TTC	2	6	2113	2118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244895
32	NC_011726	A	6	6	2121	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	218244895
33	NC_011726	AT	3	6	2168	2173	50 %	50 %	0 %	0 %	218244895
34	NC_011726	AACT	2	8	2177	2184	50 %	25 %	0 %	25 %	218244895
35	NC_011726	TCC	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244895
36	NC_011726	CGA	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244895
37	NC_011726	GAGTT	2	10	2448	2457	20 %	40 %	40 %	0 %	218244895
38	NC_011726	GAA	2	6	2472	2477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244895
39	NC_011726	TA	3	6	2506	2511	50 %	50 %	0 %	0 %	218244895
40	NC_011726	ATC	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244896
41	NC_011726	A	6	6	3104	3109	100 %	0 %	0 %	0 %	218244896
42	NC_011726	ACAA	2	8	3115	3122	75 %	0 %	0 %	25 %	218244896
43	NC_011726	A	7	7	3134	3140	100 %	0 %	0 %	0 %	218244896
44	NC_011726	AAT	2	6	3164	3169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244896
45	NC_011726	CGT	2	6	3221	3226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244896
46	NC_011726	ATT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244896
47	NC_011726	TTAA	2	8	3353	3360	50 %	50 %	0 %	0 %	218244896
48	NC_011726	TTG	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244896
49	NC_011726	AAAAT	2	10	3431	3440	80 %	20 %	0 %	0 %	218244896
50	NC_011726	AGC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244896
51	NC_011726	GTC	2	6	3505	3510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244896
52	NC_011726	AAT	2	6	3518	3523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244896
53	NC_011726	GGA	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244896
54	NC_011726	ATC	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244896
55	NC_011726	GAA	2	6	3587	3592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244896
56	NC_011726	CAA	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244896
57	NC_011726	AAT	2	6	3692	3697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244896
58	NC_011726	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244896
59	NC_011726	CGTT	2	8	3814	3821	0 %	50 %	25 %	25 %	218244896
60	NC_011726	ATG	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244896
61	NC_011726	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244896
62	NC_011726	A	6	6	3847	3852	100 %	0 %	0 %	0 %	218244896
63	NC_011726	T	6	6	3867	3872	0 %	100 %	0 %	0 %	218244896
64	NC_011726	ATA	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244896
65	NC_011726	CTT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244896
66	NC_011726	CAAT	2	8	3955	3962	50 %	25 %	0 %	25 %	218244896
67	NC_011726	ACA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244896
68	NC_011726	CAAG	2	8	4063	4070	50 %	0 %	25 %	25 %	218244896
69	NC_011726	T	6	6	4096	4101	0 %	100 %	0 %	0 %	218244896
70	NC_011726	T	6	6	4229	4234	0 %	100 %	0 %	0 %	218244897
71	NC_011726	GGC	2	6	4260	4265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218244897
72	NC_011726	TTC	2	6	4309	4314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244897
73	NC_011726	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244897
74	NC_011726	A	6	6	4402	4407	100 %	0 %	0 %	0 %	218244897
75	NC_011726	TA	3	6	4471	4476	50 %	50 %	0 %	0 %	218244897
76	NC_011726	CAAA	2	8	4515	4522	75 %	0 %	0 %	25 %	218244897
77	NC_011726	TGAT	2	8	4529	4536	25 %	50 %	25 %	0 %	218244897
78	NC_011726	CAAC	2	8	4561	4568	50 %	0 %	0 %	50 %	218244897
79	NC_011726	ATA	2	6	4584	4589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244897
80	NC_011726	TCCG	2	8	4596	4603	0 %	25 %	25 %	50 %	218244897
81	NC_011726	CCCA	2	8	4630	4637	25 %	0 %	0 %	75 %	218244897
82	NC_011726	ATA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244897
83	NC_011726	CTAGA	2	10	4671	4680	40 %	20 %	20 %	20 %	218244897
84	NC_011726	AAT	2	6	4717	4722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244897
85	NC_011726	CCA	2	6	4729	4734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218244897
86	NC_011726	TAA	2	6	4786	4791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244897
87	NC_011726	A	8	8	4900	4907	100 %	0 %	0 %	0 %	218244897
88	NC_011726	A	6	6	4931	4936	100 %	0 %	0 %	0 %	218244897
89	NC_011726	TTC	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244897
90	NC_011726	GTT	2	6	4961	4966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244897
91	NC_011726	TTG	2	6	4968	4973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244897
92	NC_011726	AT	3	6	5102	5107	50 %	50 %	0 %	0 %	218244898
93	NC_011726	GTA	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244898
94	NC_011726	AGC	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244898
95	NC_011726	TAA	2	6	5192	5197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244898
96	NC_011726	AGT	2	6	5277	5282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244898
97	NC_011726	TTA	2	6	5466	5471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
98	NC_011726	ATT	2	6	5525	5530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
99	NC_011726	CCA	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218244899
100	NC_011726	CCT	2	6	5547	5552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244899
101	NC_011726	ATT	2	6	5567	5572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
102	NC_011726	T	6	6	5590	5595	0 %	100 %	0 %	0 %	218244899
103	NC_011726	TGT	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244899
104	NC_011726	TTTA	2	8	5618	5625	25 %	75 %	0 %	0 %	218244899
105	NC_011726	TTA	2	6	5634	5639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
106	NC_011726	TAA	2	6	5692	5697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244899
107	NC_011726	AGG	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244899
108	NC_011726	TTA	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
109	NC_011726	TTATT	2	10	5791	5800	20 %	80 %	0 %	0 %	218244899
110	NC_011726	TA	3	6	5805	5810	50 %	50 %	0 %	0 %	218244899
111	NC_011726	T	6	6	5817	5822	0 %	100 %	0 %	0 %	218244899
112	NC_011726	ATT	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
113	NC_011726	TTTAGG	2	12	5906	5917	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218244899
114	NC_011726	TTA	2	6	5931	5936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
115	NC_011726	TTGT	2	8	5989	5996	0 %	75 %	25 %	0 %	218244899
116	NC_011726	ATT	2	6	6032	6037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
117	NC_011726	TTG	2	6	6281	6286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244900
118	NC_011726	CAT	2	6	6398	6403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244900
119	NC_011726	TAA	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244900
120	NC_011726	T	6	6	6448	6453	0 %	100 %	0 %	0 %	218244900
121	NC_011726	TAAT	2	8	6469	6476	50 %	50 %	0 %	0 %	218244900
122	NC_011726	A	6	6	6548	6553	100 %	0 %	0 %	0 %	218244900
123	NC_011726	GTT	2	6	6603	6608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244900
124	NC_011726	T	7	7	6607	6613	0 %	100 %	0 %	0 %	218244900
125	NC_011726	AACC	2	8	6621	6628	50 %	0 %	0 %	50 %	218244900
126	NC_011726	CAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244900
127	NC_011726	TTC	2	6	6758	6763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244900
128	NC_011726	CTTGA	2	10	6773	6782	20 %	40 %	20 %	20 %	218244900
129	NC_011726	TA	3	6	6784	6789	50 %	50 %	0 %	0 %	218244900
130	NC_011726	GCT	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244900
131	NC_011726	AT	3	6	7003	7008	50 %	50 %	0 %	0 %	218244900
132	NC_011726	A	6	6	7042	7047	100 %	0 %	0 %	0 %	218244900
133	NC_011726	TTG	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244900
134	NC_011726	TAA	2	6	7121	7126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244900
135	NC_011726	CTT	2	6	7135	7140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244900
136	NC_011726	CA	3	6	7174	7179	50 %	0 %	0 %	50 %	218244900
137	NC_011726	TAA	3	9	7187	7195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244900
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398	NC_011726	AAT	2	6	21760	21765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244914
399	NC_011726	ATA	2	6	21800	21805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244914
400	NC_011726	TTA	2	6	21836	21841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244914
401	NC_011726	T	8	8	21896	21903	0 %	100 %	0 %	0 %	218244914
402	NC_011726	AAT	2	6	21907	21912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244914
403	NC_011726	GATCAA	2	12	21945	21956	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218244914
404	NC_011726	GAT	2	6	22008	22013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244914
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410	NC_011726	AAT	2	6	22184	22189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244914
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428	NC_011726	ACA	2	6	22952	22957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244915
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479	NC_011726	AGGA	2	8	25125	25132	50 %	0 %	50 %	0 %	218244917
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